Ein weiterer Forschungsschwerpunkt der Evolutionsbiologie ist die Rekonstruktion von Stammbäumen, wobei die Gemeinsamkeiten in ursprüngliche und abgeleitete Gemeinsamkeiten geordnet werden. Welche Gemeinsamkeiten sind von gemeinsamen Vorfahren geerbt worden und welche sind konvergent entstanden? Hier wird die Kompetenz in Erkenntnisgewinnung vertieft, indem die Schüler*innen Verwandtschaftshypothesen aufstellen und testen.