Springe direkt zu Inhalt

AR and 3D structure database

Content:

Element allotropes

Aristotypes of Structural Chemistry

Minerals, Silicates

Intermetallics

Metal-organic frameworks

Noble gas compounds

Bravais lattices and space groups

Atomic orbitals


Element allotropes

Structure

(Object Code)

3D Representation (link) Reference

α-F2

(0V8J21)

 

S. I. Ivlev, A. J. Karttunen, M. Hoelzel, M. Conrad, F. Kraus, Chem. Eur. J. 201925, 3310. 

 α-Po

(R65Q22)

   R. J. DeSando, R. C. Lange, J. Inorg. Nucl. Chem. 196628, 1837.

 α-S8

(2VME51)

   S. A. Gromilov, D. A. Piryazev, N. B. Egorov, D. V. Akimov, J. Struct. Chem. 201657, 1663.

 As (gray)

(MY5VK4)

   D. Schiferl, C. S. Barrett, J. Appl. Cryst. 19692, 30.

 B12

(2VMER1)

   I. Chuvashova, E. Bykova, M. Bykov, V. Svitlyk, B. Gasharova, Y.-L. Mathis, R. Caracas, L. Dubrinsky, N. Dubrovinskaia, J. Solid State Chem. 2017245, 50.
 C (Nano tubes)    M. J. Bucknum, E. A. Castro, J. Chem. Theory Comp. 20062, 775.

 C (Diamond)

(EXBGNX)

   N. Bindzus, T. Straasø, N. Wahlberg, J. Becker, L. Bjerg, N. Lock, A.-C. Dippel, B. B. Iversen, Acta Cryst. 2014A70, 39.

 C (Graphite)

(BL2QXQ)

   L. Boulet-Roblin, D. Sheptyakov, P. Borel, C. Tessier, P. Novák, C. Villevieille, J. Mater. Chem. A20175, 25574.

 C (Fullerene)

(8EXNV5)

   W. I. F. David, R. M. Ibberson, J. C. Matthewman, K. Prassides, T. J. S. Dennis, J. P. Hare, H. W. Kroto, R. Taylor, D. R. M. Walton, Nature1991353, 147.
 Cl2    B. M. Powell, K. M. Heal, B. H. Torrie, Mol. Phys. 198453, 929.

 Cu

(JYPNR5)

   D. Huang, S. Liu, H. Xu, Y. Du, J. Alloys Comp. 2016688, 1115.
 γ-Ga    L. Bosio, H. Curien, M. Dupont, A. Rimsky, Acta Cryst. B 197228, 1974.
 I2    F. Bertolotti, A. V. Shishkina, A. Forni, G. Gervasio, A. I. Stash, V. G. Tsirelson, Cryst. Growth Des. 201414, 3587.

 Mg

(KVQJ04)

   V. V. Shtender, O. Y. Zelinska, V. V. Pavlyuk, R. V. Denys, V. Paul-Boncour, I. Y. Zavaliy, B. Marciniak, E. Różycka-Sokołowska, Intermetallics 201787, 61.
 P (Fibers)    M. Ruck, D. Hoppe, B. Wahl, P. Simon, Y. Wang, G. Seifert, Angew. Chem. 2005117, 7788.

 P (Hittorf)

(XK1J6L)

   G. Schusteritsch, M. Uhrin, C. J. Pickard, Nano Lett. 2016, 16, 2975.
 P (Hittorfene)    G. Schusteritsch, M. Uhrin, C. J. Pickard, Nano Lett. 2016, 16, 2975.

 P (black)

(P4Q5VQ)

  
W. A. Crichton, M. Mezouar, G. Monaco, S. Falconi, Powder Diffr. 200318, 155.

 P (white)

(LV98LQ)

   A. Simon, H. Borrmann, H. Craubner, Phosphorus Sulfur 198730, 507.

 Se (gray)

(1Y8PLJ)

   R. Keller, W. B. Holzapfel, H. Schulz, Phys. Rev. B 197716, 4404.

 W

(6RPBJK)

   A. Friedrich, B. Winkler, L. Bayarjargal, E. A. J. Arellano, W. Morgenroth, J. Biehler, F. Schröder, J. Yan, S. M. Clark, J. Alloys Comp. 2010502, 5.


Aristotypes of structural chemistry

Structure 3D Representation (link) Reference

Al2O3 (Corundum)

(DL05YR)

  N. Ishizawa, T. Miyata, I. Minato, F. Marumo, S. Iwai, Acta Cryst. B 198036, 228.

BiI3

(49JN68)

  M. Ruck, Z. Kristallogr. 1995210, 650.
 α-BN   E. Budak, Ç. Bozkurt, Physica B. Cond. Mat. 2010405, 4702.

 CaC2

(NVGQJD)

  M. Knapp, U. Ruschewitz, Chem. Eur. J. 20017, 874.

CaF2

(QDNGQ5)

  M. Stachowicz, M. Malinska, J. Parafiniuk, K. Woźniak, Acta Cryst. 2017B73, 643.

 Ca[TiO3] (Perovskite)

(92BN65)

  M. Yashima, R. Ali, Solid State Ionics 2009180, 120.

CdCl2

(P4Q5K8)

  D. E. Partin, M. O'Keeffe, J. Solid State Chem. 199195, 176.

CdI2

(1Y8PV5)

  B. Palosz, E. Salje, J. Appl. Cryst. 198922, 622. 

CrCl3

(NVGQ0X)

  B. Moroson, A. Narath, J. Chem. Phys. 196440, 1958.

 CsCl

(YV1JKB)

  M. Sist, K. F. F. Fischer, H. Kasai, B. B. Iversen, Angew. Chem. Int. Ed. 201756, 3625.
 Cu2O (Cuprite)   M. L. Foo, Q. Huang, J. W. Lynn, W.-L. Lee, T. Klimczuk, I. S. Hagemann, N. P. Ong, R. J. Cava, J. Solid. State. Chem. 2006179, 563.
 Cu3Au   R. Kubiak, J. Janczak, J. Alloys Comp. 1991176, 133.

 FeTiO3 (Ilmenite)

(WK1JLR)

  T. Yamanaka, J. Synchrotron Rad. 200512, 566.

 FeS2

(QDNGJQ)

  M. Rieder, J. C. Crelling, O. Šustai, M. Drábek, Z. Weiss, M. Lementová, Int. J. Coal Geology 2007, 71, 115.

 MgAl2O4 (Spinel)

(92KB5Q)

  T. Yamanaka, Y. Takéuchi, Z. Kristallogr. 1983165, 65.

 MoCl3

(55XP4Y)

  H. Hillebrecht, P. J. Schmidt, H. W. Rotter, G. Thiele, P. Zönnchen, H. Bengel, H.-J. Cantow, S. N. Magonov, M.-H. Whangbo, J. Alloys Compd. 1997246, 70. 

MoS2

(YV1J0B)

  O. Hassel, Z. Kristallogr. 1924, 61, 92.

NaCl

(WK1J0R)

  P. Fontana, J. Schefer, D. Pettit, J. Cryst. Growth 2011324, 207.

NiAs

(49JNL8)

  G. Arminoff, Z. Kristallogr. 192358, 203.
PbO (red)   P. Boher, P. Garnier, J. R. Gavarri, A. W. Hewat, J. Solid State Chem. 198557, 343.
 PtS   F. Grønvold, H. Haraldsen, A. Kjekshus, Acta Chem. Scand. 196014, 1879.

 ReO3

(MY5V64)

  K. Meisel, Z. Anorg. Allg. Chem. 1932207, 121. 
 SiO2 (Cristobalite)   P. Dera, J. D. Lazarz, V. B. Prakapenka, M. Barkley, R. T. Downs, Phys. Chem. Min. 201138, 517. 

 SiO2 (Quartz)

(92KBM6)

  K. Kihara, Eur. J. Min. 19902, 63.
 SiO2 (Tridymite)   K. Kihara, T. Matsumoto, M. Imamura, Z. Kristallogr. 1986177, 39.

 SiS2

(EXBG8X)

  J. Evers, P. Mayer, L. Möckl, G. Oehlinger, R. Köppe, H. Schnöckel, Inorg. Chem. 201554, 1240. 

TiO2 (Rutile)

(GMDRW2)

  K. Sugiyama, Y. Takéuchi, Z. Kristallogr. 1991194, 305.
 VF3   P. Daniel, A. Bulou, M. Leblanc, M. Rousseau, J. Nouet, Mat. Res. Bull. 199025, 413. 

 ZnS (Wurzite)

(GMDR5X)

  E. H. Kisi, M. M. Elcombe, Acta Cryst. 1989C45, 1867. 

 ZnS (Zincblende)

(55XPK0)

  B. T. Sendja, D. T. Kamgne, G. Aquilanti, L. Olivi, J. R. Plaisier, Physica B: Cond. Mat. 2018545, 481.
ZrI3   A. Lachgar, D. S. Dudis, J. D. Corbett, Inorg. Chem. 199029, 2242.



Minerals, Silicates, and selected oxides and sulfides

Structure (Object Code) 3D Representation (link) Reference
Alum   M. I. Kay, D. T. Cromer, Acta Cryst. 1970B26, 1349.

Beryl

(1Y8PEJ)

  G. Bergerhoff, W. Nowacki, Schweiz. Miner. Petr. Mitt. 195535, 410.

Ca2[Mo6S8]

(6RBQE0)

  F. Kubel, K. Yvon, Solid State Commun. 198972, 1219.
Chondrodite   K. Robinson, G. V. Gibbs, P. H. Ribbe, Am. Mineral. 197358, 43. 
Diopsite   A. M. Plonka, P. Dera, P. Irmen, M. L. Rivers, L. Ehm, J. B. Parise, Geophys. Res. Lett. 201239, L24307.

Faujasith

(QDNGV5)

  S. M. Seo, D. J. Moon, J. An, H.-K. Jeong, W. T. Lim, J. Phys. Chem. C 2016120, 28563.
Gehlenite   P. Karczak, F. Raaz, Anz. Oester. Akad. Wiss. Math.-Nat. Kl. 1967104, 383. 
Garnet (Pyrope)    E. P. Meagher, Am. Mineral. 197560, 218. 
Garnet (Almandine)   T. Armbruster, C. A. Geiger, G. A. Lager, Am. Mineral. 199277, 512. 
Garnet (Spessartine)   U. Rodehorst, C. A. Geiger, T. Armbruster, Am. Mineral. 200287, 542. 
Muskovite   J.-J. Liang, F. C. Hawthorne, Can. Mineral199634, 115.

Olivine

(92KBQ6)

  F. Princivalle, L. Secco, Tschermaks min. pet. Mitt. 198534, 105.
Phenakite   R. M. Hazen, A. Y. Au, Phys. Chem. Min. 198613, 69.
Pyroxene   B. Periotto, T. Balić-Žunić, F. Nestola, A. Katerinopoulou, R. J. Angel, Am. Mineral. 201297, 1741.

Sodalite

(55XPW0)

  J. Löns, H. Schulz, Acta Cryst. 196723, 434.

Topaz

(GMDR9X)

  G. D. Gatta, F. Nestola, G. D. Bromiley, A. Loose, Am. Mineral. 200691, 1839.

YBa2Cu3O7

(LV9806)

  P. Schweiss, W. Reichardt, M. Braden, G. Collin, G. Heger, H. Claus, A. Erb, Phys. Rev. B 199449, 1387.

Zeolite A

(1YP695)

  R. Y. Yanagida, A. A. Amaro, K. Seff, J Phys. Chem. 197377, 805.

Zircon

(R65Q88)

  Z. Mursic, T. Vogt, H. Boysen, F. Frey, J. Appl. Cryst. 199225, 519.

Intermetallics and related

Structure 3D Representation (link) Reference
AlB2   M. Merz, P. Schweiss, T. Wolf, H. von Löhneysen, S. Schuppler, J. Phys. Soc. Jpn. 201483, 024714.

Ca2Si

(6RPBYK)

  R. Nedumkandathil, D. E. Benson, J. Grins, K. Spektor, U. Häussermann, J. Solid State Chem. 2015222, 18.

CaSi

(KVQJR4)

  A. Currao, J. Curda, R. Nesper, Z. Anorg. Allg. Chem. 1996622, 85.

Cu2MnAl

(JYPNL5)

  K. H. J. Buschow, P. G. van Engen, J. Magn. Magn. Mat. 198125, 90.
Cu9Al4   L. Arnberg, S. Westman, Acta Cryst. 1978A34, 399.
MgCu2   M. H. Braga, J. J. A. Ferreira, J. Siewenie, T. Proffen, S. C. Vogel, L. L. Daemen, J. Solid State Chem2010183, 10. 

NaSi

(VP1EG4)

  J. Witte, H. G. Schnering, W. Klemm, Z. Anorg. Allg. Chem. 1964327, 260.

NaTl

(DL05VR)

  M. Tadin, J. Schneider, H. Boysen, F. Frey, Mat. Science Forum 199179-82, 635.

Metal-organic frameworks


Structure (Object Code) 3D Representation (link) Reference

MOF-5

(VP1EY4)

  H. Li, M. Eddaoudi, M. O'Keeffe, O. M. Yaghi, Nature1999402, 276.
     
     

Noble gas compounds

Structure 3D Representation (link) Reference
XeF2    H. St. A. Elliott, J. F. Lehmann, H. P. A. Mercier, H. D. B. Jenkins, G. J. Schrobilgen, Inorg. Chem. 2010, 49, 8504.
XeF    D. H. Templeton, A. Zalkin, J. D. Forrester, S. M. Williamson, J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 242. 
XeF6     S. Hoyer, T. Emmler, K. Seppelt, J. Fluorine Chem. 2006, 127, 1415. 
(NMe4)[XeF5    K. O. Christe, E. C. Curtis, D. A. Dixon, H. P. Mercier, J. C. P. Sanders, G. J. Schrobilgen, J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 3351. 
Cs[XeF7    A. Ellern, A.-R. Mahjoub, K. Seppelt, Angew. Chem. 1996, 108, 1198. 
(AuXe4)[Sb2F11]2     T. Drews, S. Seidel, K. Seppelt, Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 454. 
[(C6F5Xe)2Cl][AsF6    H.-J. Frohn, T. Schroer, G. Henkel, Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 2554. 
(XeOTeF5)[Sb(OTeF5)6]·SO2ClF     H. P. A. Mercier, M. D. Moran, J. C. P. Sanders, G. J. Schrobilgen, R. J. Suontamo, Inorg. Chem. 2005, 44, 49. 

Selected Bravais Lattices and Space Groups


Lattice/Space Group 3D Representation (Link)
Triklinic primitive  
Monoclinic primitive  
Monoclinic base centered   
Orthorhombic base centered  
Tetragonal primitive  
Rhombohedral  
Hexagonal primitive  
Cubic primitive  
Cubic body centered  
Cubic face centered  
-1  
2  
21  
21/m  
21/c  
2221  
P n m a  
42/m  
32 1  
32 1  
3 2  
F m -3 m (Screws)  
F m -3 m (Mirrows)  

Atomic orbitals

Calculation and depiction of orbitals for Eu: Gaussian-16[1] (HF/SDDAll[2]), www.makexyz.com/convert/wrl-to-stl, and Windows 3D Builder. 

[1] Gaussian 16, Revision C.01, M. J. Frisch, et al. Gaussian, Inc. Wallingford CT, 2016.. 

[2] T. H. Dunning Jr, P. J. Hay, Modern Theoretical Chemistry, Ed. H. F. Schaefer III, Vol. 3 (Plenum, New York, 1977) 1-28.

Orbital (Object Code) 3D Representation (link)
1s  
 2p  
 3dxy   
3dz2   
3pz   

4fz3 

(8EXNW5)

 

4fz(x2-y2)

(XK1JRL)

The database is constantly expanded. For suggestions, if you encounter errors, or to obtain the full database please contact guenther.thiele@fu-berlin.de directly. 

This work was supported by an E-Learning grant from CeDiS - Center für Digitale Systeme of the Freie Universität Berlin. 

Creative Commons License
AR/3D Structural Database by Jonas R. Schmid, Günther Thiele is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.