Genomische Diversität von Arnika über die Zeit - Master-Projekt
Der Evolution zuschauen
Genetische Diversität ist eine der drei Dimensionen biologischer Diversität, die mit der Convention on Biological Diversity (CBD) der Vereinten Nationen geschützt werden soll. Doch wie kann man diese am besten messen? In einem Pilotprojekt soll getestet werden, welche Aussagekraft Zeitreihendaten aus Stichproben von einzelnen Vorkommen der seit einigen Jahrzehnten deutlich seltener werdenden Medizinalpflanze Arnika (Arnica montana) haben. Wie lässt sich damit der Erfolg von Pflege- und Populationsstützungsmaßnahmen messen und kann man Schwankungen oder Unterschiede im jeweiligen Anteil klonaler Vermehrung erkennen?
Mitttels Restriction-site Associated DNA-Sequenzierung (RADseq) wird eine definierte Teilmenge des Genoms von Arnika-Proben aus mehreren Populationen und Jahren sequenziert. Anschließend werden die Proben anhand ihrer Sequenz-Daten sowie des Arnika-Referenzgenoms genotypisiert und die Ergebnisse über die Zeit verglichen. Die regelmäßige Kommunikation des Projektfortschritts über social media und andere Kanäle ist Bestandteil des Projektes.
- Methoden: PCR und weitere Labormethoden, Illumina-Sequenzierung, bioinformatische Datenanalyse
- Beginn: ab August, spätestens ab Dezember 2024
- Erstbetreuung: Dr. Katja Reichel